Tarptautiniai projektai

ES 7-osios bendrosios programos projektai

• FP7 ERA-NET “SUMFOREST” „Vertės grandinių tvarumo scenarijų lyginamoji analizė“. 2017–2019 m. Koordinatorius Miškų institute dr. Marius Aleinikovas.
• FP7-ERANET-2013-RTD „Patogūs naudotojui IKOK įrankiai paremti IT sprendimais - lapų dėmėtligių kontrolei javuose" (SpotIT), 2017–2019 m.  Koordinatorius Žemdirbystės institute dr. Antanas Ronis.
• FP7-ERANET-CORE Organic Plus „Derlingumo formavimo valdymas ekologinėse augalininkystės sistemose”. 2015–2017 m. Projekto vadovė dr. Žydrė Kadžiulienė.

COST programos veiklos

• FP1406 „Pušų vėžio Gibberella circinata kontroliavimo strategija šiltnamiuose ir miškuose". Veiklos laikotarpis 2015–2019 m. Valdymo komiteto narys Vokės filiale dr. Audrius Kačergius.
• FA1306  „Atsparių veislių paieška – fenotipavimas augalo ir ląstelės lygmenyje“. Veiklos laikotarpis 2014–2018 m. Valdymo komiteto narys Sodininkystės ir daržininkystės institute dr. Rytis Rugienius.
• FP1303 „Biologinių statybinių medžiagų galimybės“. Veiklos laikotarpis 2013-05-16–2017-10-21. Valdymo komiteto narys Miškų institute dr. Mindaugas Škėma.
• FP1301 „Atžalinės kilmės miškų inovatyvus tvarkymas ir daugiafunkcinis naudojimas – ateities ekologinių, ekonominių ir socialinių iššūkių Europos miškų sektoriuje sprendimas" (EuroCoppice). Veiklos laikotarpis 2013-05-16–2017-10-15. Valdymo komiteto narė Miškų institute dr. Liana Sadauskienė.
• FP1203 „Europos nemedieninių miško išteklių tinklas“. Veiklos laikotarpis 2012-11-21–2017-04-08. Valdymo komiteto narė Miškų institute dr. Olgirda Belova.

Europos teritorinio bendradarbiavimo programų projektai

• R004 „Netechnologinių inovacijų diegimo bei inovatyvumo skatinimas vaisių auginimo bei perdirbimo srityse pasirinktose Baltijos jūros regiono šalyse“. 2016–2019 m. Koordinatorius Sodininkystės ir daržininkystės institute dr. Darius Kviklys

INTERREG programos projektai

Horizon 2020 programos  projektai

• „Tvarių, paremtų pupinių augalų auginimu, ūkininkavimo sistemų ir pašarų gamybos bei maisto grandinių skatinimas ES“ (LEGVALUE), 2017–2021 m. Koordinatorė Žemdirbystės institute dr. Žydrė Kadžiulienė.
• ,,Miško medžių genetinių išteklių išsaugojimo optimizavimas ir tvarus naudojimas Europoje” (GENTREE), 2016–2020 m. Koordinatorius Miškų institute dr. Darius Danusevičius.
• ,,European Fruit Network“, 2016–2019 m. Koordinatorius Sodininkystės ir daržininkystės institute dr. Audrius Sasnauskas.

Kitų Europos Sąjungos mokslinius tyrimus remiančių programų projektai

• „Gerosios praktikos žinių pasikeitimas siekiant išlaikyti sveiką dirvožemį Europoje (BEST4SOIL)“. 2017–2020 m. Koordinatorius Žemdirbystės institute dr. Antanas Ronis.
• Švedijos instituto Baltijos jūros regiono bendradarbiavimo  projektas „Baltijos jūros regiono tinklas subalansuotam kviečių auginimui“ (BALTICWHEAT). 2017–2018 m. Koordinatorė Žemdirbystės institute dr. Rita Armonienė.
• Švedijos instituto Baltijos jūros regiono bendradarbiavimo projektas „Baltijos šalių bendradarbiavimas kuriant Fusarium protrūkių prognozavimo strategijas“. 2017–2018 m. Koordinatorė Žemdirbystės institute dr. Skaidrė Supronienė.
• Ilgalaikė miškų tyrimo programa CoFoRD 14C/846: FORM – „Nauji miško tvarkymo tyrimai siekiant padidinti raktinių miško rūšių produktyvumą, atsparumą kenkėjams ir ligoms - Atsparumo Chalara fraxinea strateginiai tyrimai ir technologijų plėtra“. 2016–2019 m. Koordinatorius Miškų institute prof. dr. Alfas Pliūra.
• SNS-NKJ projektas „Miškų ir žemės ūkio bioenergijos produkcijos poveikis ekosistemų paslaugoms Šiaurės ir Baltijos šalių kraštovaizdyje“. 2016–2017 m. Koordinatorius Miškų institute dr. Kęstutis Armolaitis.
• „Daugiametės svidrės selekciniai tyrimai Šiaurės ir Baltijos šalyse“. 2014–2018 m. Koordinatorius Žemdirbystės institute dr. Gintaras Brazauskas.
• „Europos miško genetinių išteklių programa EUFORGEN – IV“. Nuo 2010 m. Koordinatorius Miškų institute dr. Virgilijus Baliuckas.
• SNS (Nordic Forest Research Cooperation Comittee) projektas „Šiaurės Europos šalių ilgalaikių miško eksperimentų internetinės duomenų bazės išvystymas ir palaikymas“. 2017 m. Koordinatorius Miškų institute dr. Virgilijus Baliuckas.
• SNS (Nordic Forest Research Co-operation Comittee) projektas CAR-ES „Pažangių aplinkotyros tyrimų centras”, 2016–2020 m. Koordinatorė Miškų institute dr. Iveta Varnagirytė-Kabašinskienė.